Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssr4Q62186 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms