Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbm38Q62176 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbm38Q62176 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbm38Q62176 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm38Q62176 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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