Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
AtrxQ61687 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AtrxQ61687 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms