Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli3Q61602 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms