Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf9Q61179 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms