Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms