Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Neurod1Q60867 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Neurod1Q60867 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms