Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stxbp3Q60770 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stxbp3Q60770 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms