Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms