Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr2f1Q60632 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr2f1Q60632 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms