Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sin3aQ60520 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3aQ60520 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3aQ60520 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms