Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a3Q5XF89 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms