Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd5Q5VCS6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Tdrd5Q5VCS6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Tdrd5Q5VCS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms