Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scaf1Q5U4C3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms