Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med13Q5SWW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms