Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms