Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms