Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d1Q5SSN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms