Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms