Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps54Q5SPW0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps54Q5SPW0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms