Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
5730522E02RikQ5SP45 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms