Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms