Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3kQ5GIG6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms