Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm3Q5F4S9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms