Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chsy3Q5DTK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chsy3Q5DTK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms