Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prune2Q52KR3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms