Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccnl1Q52KE7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms