Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms