Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shank3Q4ACU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shank3Q4ACU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms