Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms