Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr7Q3V0I2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr7Q3V0I2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms