Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E330034G19RikQ3UWX6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms