Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TceancQ3US16 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TceancQ3US16 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms