Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc190Q3URK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc190Q3URK1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms