Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep63Q3UPP8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep63Q3UPP8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms