Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms