Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rnf224Q3UIW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rnf224Q3UIW8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rnf224Q3UIW8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rnf224Q3UIW8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rnf224Q3UIW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf224Q3UIW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf224Q3UIW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms