Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms