Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms