Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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