Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Palb2Q3U0P1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms