Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms