Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh5Q3TSG4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms