Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms