Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem248Q3TBN1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms