Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna5Q2MKA5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna5Q2MKA5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms