Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp1aQ2LKU9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms