Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shroom4Q1W617 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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Shroom4Q1W617 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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Shroom4Q1W617 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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