Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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