Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms